ביאור יש"ר על התורה, בראשית א:י

ויקרא אלהים ליבשה ארץ, לפי שמלת ארץ שבפסוק ראשון כוללת כל אשר תחת השמים הרוח והמים והעפר וכל אשר בהם, ולכן קרא כאן בפרט ליבשה ארץ לתת כלל על הזכרת מלת ארץ בתורה שמדבר על היבשה:

ולמקוה המים קרא ימים, שם ים נופל בלש"הק על החלל שבו נקווים המים, וקרקעית הים נקרא תהום, והמים שבחלל נקראו מי הים, ולפי שיש בעולם ימים רבים וכולם ממקום אחד יצאו, לכן אמר ולמקוה בלשון יחיד וימים בלשון רבים, והנה עם זה נשלם התיקון של בהו, כי עתה כל דבר נכנס בגדרו ובמקומו הראוי לו, גם הבדיל השם ביניהם לבל יתערבו עוד יחד ולא יעברו גבולם: